氢气发生器和氮气发生器，要注重所用试剂的纯度以及管路是否漏气，水蒸气是首要的杂质。为了除去杂质的气体中，要在气源和仪器之间连接净扮装置。如分子筛或活性炭吸去除分子有机化合物，水蒸汽经由过程彩色胶除去。分子筛纯化，活性炭和硅胶，在使用一段时间后，注意查抄和更换，更换后的填料可以从头活化继续使用，但要注重填充物的粉末堵塞气体路径。

如果仪器长期使用低纯度的气体气源，一旦低浓度的需求过高，样品以高纯度要求，在要想恢复仪器的高灵敏度是十分困难的。如果选用高纯度的气体，这不仅会增添运营成本，还增添了的气体路径的复杂性，所以选用气体的纯度要求达到或略高于仪器自身对气体纯度的要求即可，这是为了达到工作要求，但也耽误了仪器的使用寿命，进一步节省运营成本的东西。
为确保安全用气，还需要考虑废气（放空气体）的排放安全。如隔垫吹扫气体，分流放空口和检测器放空口等管路应尽量接到室外（利用氢气为载气时，它必需向屋外）。避免有毒和有害物质的室内空气污染，危及操作者的健康， 同时也考虑氢气作载气时的安全问题。
由于尝试室备用气瓶，通风便利，所以氮气利用的是钢瓶；考虑到氢气的利用安全，利用氢气发生器；空气源利用的是空气压缩机。为了去除气态杂质，氮气气缸和氢生成装有硅胶吸附装置空气发生器设置装备摆设硅胶吸附器及一半活性炭和一半分子筛的吸附装置。

仪器工作过程中的排空气体（隔垫吹扫气、分流出口，检测器排气口和载波 ），你要到户外，视其对室内环境及平安的影响而定，和可燃气体，平安方面的考虑，应在*。
因为从载气隔垫吹扫气体，当用氢气作载气时需将吹扫出口用管路连接到室外。室内安全和洁净，分流放空口和检测器放空口也应尽量用管路接到室外。
气相色谱仪对各类气体（载气和辅助气）的纯度要求较高，一般要求气体纯度> 99 99％。气体源供给的气体的气相色谱仪的高压气缸或气体发生器中，在市场上的空气压缩机的今天，氢气发生器和氮气发生器，其它气瓶都可以利用。